1483年，哥伦布继承了托斯卡内里的“衣钵”，再次提出向西航行的方法，而且哥伦布的想法已经比较成熟，主要思想是以大西洋上的群岛为基地，使用“等纬度航行法”，这种方法虽然不能让你确定你会到达何处，但它的好处就是能确保你在经过足够长的时间（所以防止哗变是很重要的）之后一定能到达该纬度附近的一处陆地——如果那里真的有陆地的话。
当然，葡萄牙政府经营海上事业多年，麾下人才济济，能人辈出，因此眼光比其他欧洲国家不是一般地高，不会像西班牙、英格兰、法兰西那样逮住一个是一个。
所以“研究”之后，葡萄牙政府拒绝了哥伦布的建议。
但是送上门的建议就要尝试，于是葡萄牙背着哥伦布搞了一次失败的航行，然后，就没有然后了。
发现新大陆的机遇第二次错过了葡萄牙。
……
当然，葡萄牙的航海事业仍然是越来越红火。1487年迪亚士的航行成功越过非洲最南端，抵达了好望角。
迪亚士后来的运气却不是很好。1500年卡布拉尔远征印度的船队偏航到巴西，回国报道发现新土地的喜讯时船队遭遇了海难，遇难者名单中赫然有迪亚士的大名。
“近代航海几人回”，看来不是一句空话。
1488年，对于葡萄牙，这是非常重要和关键的一年，在迪亚士返航的同时，两件大事发生了，对葡萄牙的未来有着重要的影响，尽管这两件事被埋没在历史的尘埃之中。
第一件大事是，葡萄牙人到达印度！
What?葡萄牙人怎么就到了印度？难不成是飞过去的?
葡萄牙人当然不是飞过去的，他们是海陆并进走过去的。
这个事是依赖一名叫科维良的间谍完成的。科维良这个间谍是地理大发现期间的一个传奇人物，从这一点来说，什么明石元二郎，维特，佐尔格，都没有科维良在历史上的贡献大。
葡萄牙王国间谍科维良乘船到达埃及的亚历山大港，然后经红海来到亚丁，最后渡阿拉伯海到达印度西部的卡纳诺尔港，并先后考察了果阿和卡里库特等地，得到了大量的资料。科维良是第一个踏上印度土地的葡萄牙人。
所以葡萄牙人那么笃定印度在东方啊，因为他们已经发现了啊！
科维良的成就不止于此，这个传奇间谍的征程远未结束。
1489年，这个创下丰功伟绩的葡萄牙王国间谍科维良离开印度到达伊朗的霍尔木兹，然后又乘船沿东非海岸来到了南纬21度线附近今属莫桑比克的索法拉，以了解波斯湾和东非的贸易和航海情况。
也就是说，科维良不仅到达了印度，还探索了非洲东海岸和西印度洋，基本上在迪亚士越过好望角的同时，非洲东海岸的航线已经被科维良摸了个一清二楚，这给达·伽马的成功准备好了敲门砖。
然而到1490年，葡萄牙王国仍不知晓这些极其重大的发现，科维良要把信息传回祖国。
1491年，刚果王国派往葡萄牙王国的使节组跟随葡萄牙使团返回刚果。刚果国王恩赞加·库武和部分贵族一道接受了基督教的洗礼。若昂二世和整个葡萄牙沐浴在荣光之中。
这一年，在海外漂泊三年。科维良回到埃及开罗并与葡萄牙派来的人接上关系，把东方的情报整理后写成长信汇报给葡王若昂二世。
如此重大的发现，科维良足以享有巨大的荣耀。
然而科维良不是航海家，而是一个间谍，间谍注定要生活在阴暗处，战斗在阴暗处。
也要消失在阴暗处。
当年，科维良又奉命前往埃塞俄比亚高原去探明“长老王国”。
风萧萧兮非土寒，间谍一去兮不复还。
“是不是有这样一个可能?科维良在埃塞俄比亚的那座传说中的教堂里，打开了上帝留下的约柜？足够写一本玄幻小说了。这样的人才，卡斯蒂利亚和阿拉贡怎么没有呢？不然我也不会如此感慨和郁闷地敲桌子了。”
无论从当时还是从今天的角度看，科维良都是一个成功的旅行家、探险家和间谍，除了环绕南部非洲的事他无法参与外，葡萄牙王国东方远征和贸易的印度洋部分被他全部探明。正是根据科维良的秘密情报，葡萄牙政府才得以制定并实施以后的达·迦马首航计划以及远征印度的战略计划。
明石元二郎的丰功伟绩，007的传奇经历，佐尔格的聪明才智，维特的神秘莫测，等于科维良。
“如果可以，我想让他做尼德霍格小组的组长，不是你。”讲完科维良的故事，斐迪南敲击着桌子，毫不留情地说出了让西斯内罗斯十分尴尬的感叹。
……
但是让我们回到1488年，在这一年，科维良的传奇历程刚刚开始的时候，又一个历史机遇摆在了葡萄牙面前，而且是第三次摆在葡萄牙面前。
和前一个故事相比，这个故事就不怎么有意思了。
一句话，哥伦布再次提出了申请。
东方有刘玄德三顾茅庐，西方有葡萄牙三拒西航。
葡萄牙：“我感受到了一股来自东方的神秘反作用力……”
陆上三战三败，海上三请三拒。
真是一个悲伤的故事。
迪亚士的航海和科维良的探险是若昂二世时期葡萄牙最后的两次重要地理探险行动，至此葡萄牙终于奠定了开辟印度航线的基础。
若昂二世的大航海辉煌不是他缔造的，而是成百上千勇敢的葡萄牙探险家、航海家甚至间谍一同缔造的。
讲完了若昂二世的大航海，我们才来说说若昂二世自己吧。
若昂二世这个人呢，他的性格就是冷酷、残忍、固执、唯利是图、斤斤计较、寸步不让。
或许当时的每个君主都有这样的内心，但是只有若昂二世表现得这么明显。了解当时各国君主的人，如果在心里给各个国王画一幅肖像，唯有若昂二世会让他心里瞬间浮现出一副阴沉沉、冷冰冰的模样——
“一看就知道那个人不是好家伙。”斐迪南对此有精辟的概括。