翌日，太极殿上，李世民将太子所作所为告之百官，并将一应叛党全部羁押上殿，李世民看着为首的侯君集问道：“你，乃寡人肱骨之臣，为何如此待寡人？”侯君集看着李世民，苦笑了两声：“太子窝囊啊，任由李泰骑在头上，陛下对其又是百般偏心，我等太子旧部，若不早做打算，莫不成要步陛下前尘？等那魏王重演玄武门之变，老臣与太子，便会便是没了生路啊！”
李世民看着侯君集，他拿着一个奏折摔倒地上说道：“我命魏征为太子师，解太子一切禁令，他除了没有入主太极殿，与我这皇帝有何区别？我儿如今被人趋使，你等不加解救，居然还助纣为虐，实在是令寡人心寒！”
李世民不再多言，重新坐在龙椅上，以往随和之气消失，浑身上下散发着凌厉之气，对着殿前诸人说道：“尔等，都不得生了！”说完这话，他的眼角闪过一丝不舍，又看了看诸人，而在殿前有一通书舍人，是晋王李治门生，名为来济，他早就听从晋王的命令，在陛下做决定时，说出这般话：“陛下，臣有一言启奏。”李世民惊讶的看向他，说道：“说！”
来济上前几步道：“陛下上不失作慈父，下得尽天年，即为善矣。”李世民听到来济这话，甚是欣慰，想不到如此小官居然能懂自己心意，便点头道：“太子之事，受人蛊惑，还未查清，但谋逆之罪不可赦免。”
李世民说到这里站了起来，在文武百官面前走下了殿来，看了看一旁的长孙无极等人，开始说话，一边是一边指一人：：“传朕旨意，太子谋逆，罪无可恕，幽禁紫云阁，司徒长孙无忌、司空房玄龄、特进萧瑀、兵部尚书李积、大理卿孙伏伽、中书侍郎岑文本、御史大夫马周、谏议大夫褚遂良你等之人前去参鞫，诸事皆明验之后，回朕言，给你们三日时间。”
说完之后，李世民回到龙椅上，看着殿前的大臣继续说道：“太子之事不能再有，既然谋乱，不可饶恕，除侯君集外，诸党凡参与此事者，赐死！主职官员诛九族！”
李世民的话说完，殿前被押的人都瘫坐在地，唯有侯君集站在哪里，他看向李世民，满目泪光说道：“老臣有负陛下的信任，老臣罪该万死啊，还请陛下保重龙体，赐死老臣！”
李世民看着曾经与自己出生入死的侯君集，实在不忍心，他不是不知道侯君集包藏祸心，但他实在是劳苦功高啊。
李世民的不忍让群臣感到一丝欣慰，天子仁德，但为臣者忠君报国，无可厚非，既然谋逆不可便更不能饶恕，如此，诸臣者全部像李世民谏言，让其处死侯君集，一是匡正朝纲，再者都是表忠心。
李世民见群臣这样说，便说道：“兵部尚书兼吏部尚书侯君集，为人臣，谋逆乱政，不可不诛，赐死，念其劳苦功高，有妻贤德，便赦免其妻儿性命，流放岭南！”
李世民说完这些，便起身离开了太极殿，侯君集跪拜谢其恩典。
立政殿，李治坐在自己做的摇椅上休憩，李世民则是慢慢悠悠的走到近前，坐在了一旁，李治有帝天的提醒，醒了过来，看到李世民坐在身边不语，问到：“阿耶，您怎么了！”李世民看着李治道：“如今，你也十五岁了，阿耶也就是你这么大的时候娶的你阿娘。”李治其身来到李世民膝下道：“阿耶想阿娘了。”李世民点点头道：“若你阿娘在，阿耶必定不会让阴德妃得手，到头来害了你父兄。”李治看着后悔的李世民道：“其实如今的父兄，是他自己的选择，阴德妃利用的，不过是他的喜好，儿子不才，占了一个色字，阴德妃不还是将刘宫人安插到了儿子身边？四兄长好吃，那府里的厨子皆本被其收买，但为什么我二人无事，那是因为我二人留心，也知道控制自己的本性，而父兄，他却没有。”
李世民看着李治，叹了一口气说道：“虽说如此，那也是阿耶的错，雉奴，武媚乃我赐给你的人，她有你阿娘的谋略，少了你阿娘的仁慈，她必定是你将来治理天下的得力助手，你不必在乎旁人，要想尽办法留她在你身边！”李治震惊的看着李世民，虽然他知道自己会当皇帝，但他并不知道原来李世民早以把他当作储君，李世民看着呆滞不语的李治继续说道：“你父兄生性猜疑，才能虽够，但不务正业，我守他太子之位已经是偏帮他，是因为我从没有想过他会赢，我宠爱你四兄，但并不属意他做帝王，他生性淡泊，爱使计量，看似绝顶聪明，但实际没有用到地方，不懂的管制自己，你与青雀之才，皆是不输于你父兄，但帝王之人必定不能如他二人那般，在三人里，只有你拥有你阿娘的仁慈和大度，我将武媚徐惠留给你，便是一早认定你将是未来的皇帝，袁天罡的话，阿耶一早便信了。”说完这句话，李世民顿了顿道：“不出几月，你便要与那太原王氏成婚，我到时候会封你为太子，想做什么，大可去做吧，只要记得，扫清那些关陇群公，让这天下真正属于我李家。”
李世民说完便离开了，没有给李治说话的时间，他如此，便是来告诉李治，他完全了解和相信他，李治站在哪里久久不语，他从不知道，阿耶会如此信任和了解自己。
紫云阁，李治来到了囚禁李承乾的宫室，他独自走进殿内，见李承乾独坐，看到前来的李治说道：“你能不能告诉我，你为何会对我的行动了如指掌。”李治对着其说道：“史书上记载的啊。”李承乾道：“一派胡言，哪有史书记载这些。”李治直接说道：“接下来的史书啊，我想问你一个问题，司云中，你活了多大年纪了？”李承乾面部狰狞的笑道：“我是杀不死的，你不该来看我，我虽然没有别的能力，但我可以永生，我可以不死不灭。”